Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkp1P97350 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkp1P97350 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms