Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgcaP82350 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgcaP82350 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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