Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad50P70388 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms