Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tbx6P70327 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tbx6P70327 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms