Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rad54lP70270 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad54lP70270 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms