Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chl1P70232 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chl1P70232 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms