Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Abcc9P70170 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Abcc9P70170 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Abcc9P70170 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Abcc9P70170 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms