Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prrx1P63013 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prrx1P63013 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms