Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lsm5P62322 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lsm5P62322 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms