Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rps29P62274 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms