Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sf3b6P59708 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms