Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms