Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Setd4P58467 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms