Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad23bP54728 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad23bP54728 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad23bP54728 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms