Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Map3k1P53349 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Map3k1P53349 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms