Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ApodP51910 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ApodP51910 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ApodP51910 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ApodP51910 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ApodP51910 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ApodP51910 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms