Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa-rs12P50716 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa-rs12P50716 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms