Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Tmod1P49813 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmod1P49813 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod1P49813 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod1P49813 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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