Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5P49615 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5P49615 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms