Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Abcd1P48410 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms