Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nedd4P46935 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nedd4P46935 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nedd4P46935 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms