Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zic1P46684 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zic1P46684 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms