Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LifrP42703 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LifrP42703 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LifrP42703 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LifrP42703 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LifrP42703 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LifrP42703 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LifrP42703 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LifrP42703 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms