Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ThpoP40226 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ThpoP40226 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms