Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtlP38585 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtlP38585 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TtlP38585 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TtlP38585 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtlP38585 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtlP38585 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms