Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1aP36536 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1aP36536 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms