Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ddit3P35639 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ddit3P35639 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms