Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2aP35436 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Grin2aP35436 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms