Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nedd1P33215 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nedd1P33215 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms