Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gsx2P31316 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsx2P31316 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms