Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GrnP28798 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GrnP28798 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GrnP28798 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GrnP28798 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GrnP28798 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GrnP28798 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms