Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RxraP28700 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RxraP28700 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RxraP28700 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RxraP28700 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RxraP28700 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RxraP28700 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RxraP28700 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RxraP28700 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RxraP28700 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms