Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctnna1P26231 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna1P26231 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms