Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd12P23812 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxd12P23812 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms