Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PparaP23204 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PparaP23204 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PparaP23204 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PparaP23204 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PparaP23204 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms