Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bmp4P21275 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bmp4P21275 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms