Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdgfaP20033 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfaP20033 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms