Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f1P17208 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms