Protein–RNA interactions for Protein: P15920

Atp6v0a2, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 2, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a2P15920 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp6v0a2P15920 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6v0a2P15920 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms