Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igsf6P0C6B7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Igsf6P0C6B7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms