Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01649 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01649 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01649 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01649 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01649 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01649 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01649 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01649 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms