Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01638 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01638 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01638 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01638 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01638 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01638 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01638 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01638 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms