Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mmp10O55123 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mmp10O55123 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms