Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngr1O55100 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngr1O55100 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms