Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SlkO54988 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SlkO54988 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SlkO54988 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SlkO54988 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SlkO54988 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SlkO54988 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SlkO54988 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms