Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DffaO54786 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DffaO54786 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DffaO54786 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DffaO54786 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms