Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NudcO35685 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NudcO35685 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NudcO35685 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NudcO35685 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NudcO35685 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NudcO35685 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NudcO35685 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NudcO35685 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NudcO35685 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NudcO35685 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms