Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6aO35464 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms