Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc1O35379 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc1O35379 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc1O35379 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms