Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dgcr6O35347 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dgcr6O35347 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms